Table 3

Overlapping of H-JNK1 signature genes with other types of HCCs

Up in

H-JNK/L-JNK

HB

HCC§

Up In HB**

mTOR

HCC

EpCAM

HCC

Down in

H-JNK1/L-JNK1

HB

HCC

Down

In HB

mTOR

HCC

EpCAM

HCC


Genes

Fold

rC2/rC1*

Genes

Fold

rC2/rC1


S100P

611

Y

CYP2D6

-112

Y

0.1

Y

S100A8

371

Y

a

Y

GYS2

-122

0.1

Y

Y

AGR2

309

F9

-141

0.1

Y

S100A9

278

a

Y

CFHR5

-148

Y

CCL20

266

Y

Y

NAT2

-151

0.2

Y

PEG10

206

14.9

Y

ADH1B

-151

0.1

CD24

163

6.7

Y

Y

SPP2

-154

a

NTS

143

Y

Y

LECT2

-155

Y

Y

SPP1

126

Y

SLC22A1

-156

Y

0.1

Y

PLAC8

121

a

Y

SLC27A5

-156

0.2

Y

H19

92

qPCR

Y

BAAT

-173

Y

Y

SPINK1

78

Y

FMO3

-183

Y

0.1

Y

Y

GALNT7

63

Y

RTP3

-217

Y

HMGA2

61

5.5

Y

ACSM2B

-222

Y

C1orf106

61

Y

CYP8B1

-224

Y

Y

Y

AMIGO2

55

Y

AFM

-239

a

Y

AFP

54

35

Y

CYP2C9

-242

Y

0.2

Y

XIST

52

CYP2E1

-244

Y

0.2

Y

UBE2C

51

Y

PCK1

-251

Y

0.1

Y

NEBL

49

OTC

-276

Y

Y

SOX4

48

3.0

Y

HSD17B6

-298

0.1

Y

IER3

45

Y

Y

GLYAT

-458

Y

0.2

Y

Y

EGLN3

42

CYP2C8

-525

0.0

Y

TMED3

40

Y

ADH4

-535

Y

PRKAR2B

40

Y

AQP9

-684

Y

0.2

Y

Y

IGFBP3

39

Y

SERPINC1

-711

Y

a

Y

S100A4

39

Y

SLC10A1

-975

0.1

Y

BASP1

38

b

HSD11B1

-1040

0.1

Y

Y

CXCL13

37

CYP3A4

-1458

Y

KRT19

34

Y

10.5

Y

HPD

-1864

Y

0.2

Y


A: Up or down in later stage HB; b: Up or down in early stage HB; *: ratio of rC2/rC1; Y: covered by the indicated studies; §HB HCC, ref.[22]; **HB: ref. [16]; mTOR HCC: ref. [11]; EpCAM HCC: ref. [12].

Chang et al. Molecular Cancer 2009 8:64   doi:10.1186/1476-4598-8-64

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